В XVI веке Ливонская конфедерация, Русское царство, Великое княжество Литовское (ВКЛ), Шведское и Датское королевства вступили в крупный и продолжительный конфликт за территории, в числе которых была и территория современной Эстонии. Этот конфликт, длившийся с 1558 по 1583 годы, получил название Ливонская война. Итогом конфликта был распад Ливонской конфедерации, Эстония была разделена между Швецией, Речью Посполитой и Данией, через полвека Южная Эстония также была передана Швеции по Альтмаркскому соглашению.
