В общем и целом правильны оба варианта: и на -у и на -е. Так же, как и мн. ч. от "цех" правильны оба варианта: цеха и цехи (согласно орфографическому словарю Ожегова и Шапиро). В современной речи конкурируют между собой две формы предложного падежа единственного числа слова цех: "в цехе" и "в цеху". Но более предпочтительным и общеупотребительным считается в цехе, в цеху устаревающий вариант.
